咽炎的病因主要为病*和细菌感染，一般由飞沫或者直接接触而传染，因为人体的咽部为鼻腔和口腔后面的孔道，一般可分为鼻咽、口咽和喉咽三个组成部分，因为咽部富含淋巴组织，所以咽部是人体阻挡病原体，尤其是病菌入侵的主要门户之一。
由于咽部的结构复杂，它很容易积攒一些食物的残渣等异物，所以细菌很容易在人的咽部停驻繁殖，并引起炎症，这是病*和细菌的感染，一般是引起咽炎的很大一部分原因。再就是全身的原因，如全身抵抗力减弱，疲劳、受凉、烟酒过度，这也是本病的常见诱因。
再就是咽炎可继发于感冒或急性扁桃体炎、急性咽炎反复发作或治疗不彻底以及邻近器官病灶刺激，如鼻窦炎、扁桃体炎、鼻咽炎、气管炎，也可以发展成慢性咽炎。再就是饮食过度，过度的食辛辣食物。烟雾、粉尘及有害气体的刺激，也可以引起咽炎。
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