1、细菌性结膜炎
轻症细菌性结膜炎是可以自限性的，在免疫系统正常的成人中不需要特异性治疗就可以自发缓解。在2~5日的治疗中，滴用抗菌药物与应用安慰剂相比，临床的改善与微生物的消退都发生得较早。这些优势持续6~10日，但是随着时间的延长，抗生素与安慰剂相比所具有的优势在减少。抗生素的选择一般是根据经验用药。因为应用广谱抗生素滴眼5~7日通常是有效的，因此可以选择使用最方便和费用最低的药物。
重症细菌性结膜炎的特征是有大量脓性分泌物、疼痛和明显的眼部炎症。如果有可能是淋病奈瑟菌感染，应当进行结膜培养和涂片后进行革兰染色。在这些病例中，可以根据实验室检查结果来指导抗菌药物的选择。从细菌性结膜炎的患者中，已越来越多地分离出耐甲氧西林的金*色葡萄球菌（MRSA）。已经发现在养老院中带有MRSA菌群的居民增加，社区获得性MRSA感染也在增加。耐甲氧西林的金*色葡萄球菌病原体对许多市售的可以买得到的抗生素滴眼液是耐药的。对于奈瑟氏林冰奈瑟菌和沙眼衣原体感染引起的结膜炎，采用全身抗生素疗法来治疗师必需的（见表5）。
虽然眼局部治疗对其是不必要的，但是还会常常应用。在淋病奈瑟菌性结膜炎中，盐水冲洗可以增加患者的舒适感，并加速炎症缓解。如果累及角膜，患者也需要使用局部药物治疗细菌性角膜炎（参考细菌性及角膜炎的眼科临床指南）。应当告知患者及其性接触者有交叉传染的可能，并予以适当的转诊和指导。当儿童中发生这种情况时，要考虑到性滥交的可能。
淋球菌性结膜炎的患者每日都必须复查，直到结膜炎缓解。每次随诊检查中，询问随诊间期病史、检查视力和裂隙灯活体显微镜检查都必须施行的。对于其他类型的细菌性结膜炎，如果病情没有好转，患者需要每3~4天复查一次。
一项流行病学研究发现在低出生体重和（或）低胎龄的新生儿加强病房内，患有结膜炎的新生儿中革兰阴性结膜炎的发生率增加，常常是对庆大霉素是耐药的。
2、衣原体性结膜炎
推荐治疗衣原体性结膜炎的方法见表5。因为超过50%患有衣原体结膜炎的婴儿也可能在其他部位同时存在感染，例如鼻腔、泌尿道或肺部，所以需要全身治疗。对于症状和体征高度提示为衣原体感染（如持续数周的滤泡性结膜炎）患者可以考虑给予经验性抗生素治疗。没有资料支持在使用全身治疗的同时要附加局部治疗。因为治疗失败的发生率高达19%，患者应当在治疗后要再次进行评估。随诊检查的内容包括询问随诊间期的病史、检查视力和裂隙灯活体显微镜检查。成人结膜炎通常对于全身治疗有效，患者的性接触者也要同时接受治疗。需要告知患者及其性接触者有传染的可能，并进行相应的指导和转诊。当儿童发生这种情况时，要考虑到性滥交的可能。
3、眼黏膜类天疱疮性结膜炎（OMMP）
如果患者正在应用与药源性黏膜类疱疮相关的药物，应当尝试试验性地停用这些药物。因为OMMP是一种慢性、进行性的疾病，具有疾病的活动性时而静止、时而加重的特点，所以很难准确地判断治疗效果。结膜的分级系统和照片可以有效地帮助评价疾病的进展。虽然局部滴用糖皮质激素治疗有助于控制急性结膜炎症，但是通常需要全身的免疫抑制剂治疗，以阻止炎症和结膜瘢痕的发展。
在治疗开始时需要考虑到疾病进展的速率、患者年龄和一般状况以及潜在的免疫抑制剂治疗的并发症，并和患者进行讨论。全身糖皮质激素治疗可以在开始时控制炎症，但是如果其他免疫抑制剂的治疗有效时，应当将其停止使用，以避免长期使用糖皮质激素的并发症。对于轻症和缓慢的进展的疾病可以使用麦考酚酯、氨苯砜、硫唑嘌呤或甲氨蝶呤治疗。炎症严重或者对其他药物治疗不敏感者的炎症，应当考虑应用环磷酰胺。这些治疗可以单独使用，也可以联合使用。通常需要具有免疫抑制剂治疗经验的内科医师对治疗进行指导和监督，以避免和控制治疗的副作用。
其他不常用但可能有效的治疗措施和辅助治疗有：口服四环素和烟酰胺，柳氮磺胺吡啶，静脉用的免疫球蛋白和结膜下注射丝裂霉素C。患者合并的干眼、倒睫，双行睫和睑内翻也需要治疗。如果患者不是严重的干眼，并且炎症已经控制良好，有结膜穹窿部缩窄的患者可以进行黏膜或羊膜移植。对于已有角膜盲的晚期患者，人工角膜手术有可能增加视力。
根据疾病的严重程度、病因和治疗来确定随诊的时间和频率，随诊应当包括询问随诊间期的病史、检查视力和裂隙灯活体显微镜检查，并记录角膜和结膜的改变，以监测疾病进展。眼部治疗如白内障手术可能会加重病情。对于这类患者必须进行围手术期的免疫抑制剂治疗和术后密切的随诊。
4、移植物抗宿主病（GVHD）
多器官系统性（GVHD）患者需要全身免疫抑制治疗。全身性糖皮质激素是起始治疗的主要用药，常常与环孢素或他克莫司联合应用。在对糖皮质激素治疗效果不好的GVHD患者中，已经研究了一些治疗方法，包括环磷酰胺、T-细胞调节剂和光泳法（photopheresis），依据病变累及的组织和疾病严重程度，而获得了不同程度的成功。
对于眼部GVHD，在治疗相当常见的伴有继发性干燥性角结膜炎的患者中，积极的应用润滑剂和泪小点栓塞是特别有用的。在治疗结膜充血时，滴用糖皮质激素滴眼液可能会有一些作用，但是缺少研究结果。可以滴用环孢素或自体血清来治疗与GVHD相关的干眼综合征。在更严重的病例中，手术切除假膜组织相对于保守治疗而言更受提倡。眼部GVHD的其他继发性并发症，如瘢痕性眼睑异位、SLK或角膜缘干细胞衰竭，应当根据每种情况进行治疗。
5、皮脂腺癌
当通过眼睑活检已经确定皮脂腺癌的诊断时，需要进行局部切除。手术应当由治疗眼睑肿瘤有经验的手术医师来施行，当手术可能残存变形性骨炎样成分时，需要进行辅助的治疗。
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